Fiel à sua natureza beneficente, a SEFAS destina pelo menos 60% de seus atendimentos ao SUS, reafirmando sua vocação de servir à população com equidade e universalidade. Todos os recursos obtidos — sejam provenientes de serviços, convênios ou doações — são integralmente aplicados em suas atividades e na melhoria dos serviços prestados à comunidade.
Mais do que uma instituição de saúde, a SEFAS é expressão concreta do carisma franciscano, cultivando o amor ao próximo e o cuidado com a criação, e buscando, a cada dia, ser instrumento de vida, paz e esperança para todos que dela se aproximam.